Virgin Crisis parla di una giovane ragazza, Miu Sakurai, che è innamorata del ragazzo più popolare della sua scuola, Shion Amamiya. Convinta che a lui non piaccia per via del suo viso infantile e del suo corpo non sviluppato, Miu si procura un libro di magia e lo utilizza per fare un incantesimo damore. Senza saperlo, evoca Satan, un bellissimo e affascinante diavolo, che esaudirà il suo desiderio se in cambio ella gli donerà la sua verginità. Lei accetta, riluttante, per amore di Shion, e così Satan tenta di fare un incantesimo per farlo innamorare di lei. Questo incantesimo non ha però effetto perché Shion è molto cattolico e Dio lo protegge. Allora Satan prende forma umana e, modificando i ricordi delle persone, entra nella classe di Miu spacciandosi per suo fratello maggiore che non ha potuto venire a scuola per due anni a causa di una malattia, così da scoprire il motivo per cui non riesce a far innamorare Shion di Miu e trovare il modo per farlo. Intanto Shion scambia di tanto in tanto qualche parola con Miu, cosa che provoca la gelosia delle più belle corteggiatrici del ragazzo che la mettono sotto una cattiva luce ai suoi occhi. E per questo Satan il diavolo evocato le spinge a supliccare perdono per le cattiverie. Dopo molti avvenimenti e lotte Miu si innamora di Satan e il suo amore viene contraccambiato.