Kazuya è un ragazzino molto timido ed insicuro delle scuole medie, vittima di bullismo da parte del suo compagno di classe ed ex-amico Ryuji, che si approffitta di lui usandolo come lacchè e facendosi prestare i soldi per comprarsi i videogiochi. Un giorno, dopo una lezione di matematica in cui dimostra il suo talento nel risolvere i problemi di logica, viene rinchiuso da Ryuji in uno strano cubo che si trova nell'aula d'arte, da cui viene in seguito liberato da un altro suo amico delle elementari, Kou, verso la fine delle lezioni. Appena però Kazuya mette piede fuori dal cubo, questo rinchiude al suo interno Ryuji, dicendo che se non riuscirà a salvarlo prima dell'alba il ragazzo morirà divorato dallo stesso cubo magico. Kazuya decide comunque di salvare l'ex-amico, sotto lo sguardo stupito di Kou, ed ha inizio quindi una corsa contro il tempo per salvare Ryuji, in cui il timido ragazzo dovrà ricorrere a tutta la sua bravura nella matematica e nella logica…..