Neo Dragoon segue le vicende dello storico generale Date Masamune, nelle sue campagne durante lepoca Sengoku (xvi secolo). La storia ha inizio nel castello di Yonezawa, nel giorno in cui Masamune viene insignito della carica di nuovo capostipite dei Date. E da qui che parte per la sua prima battaglia: riconquistare il feudo di Igu! Masamune è molto ambizioso, e non intende accontentarsi di regnare esclusivamente sulla regione giapponese del Chuuou... ma sul mondo intero! Circondato dai suoi fedelissimi e abili vassalli, Katakura Kojuurou, Date Shigezane e Harada Munetoki, e dalla moglie, la splendida (quanto letale) Megohime. Quali pericoli lo attenderanno...?