Full Metal Panic! Sigma (フルメタル・パニック! Σ」 Full Metal Panic! Sigma) è la seconda serie manga del mondo di Full Metal Panic!, scritta da Shōji Gatō e disegnata da Hiroshi Ueda (character design Shikidouji). Edita in Italia da Planet Manga a partire da giugno 2008. Il giovane sergente Sousuke Sagara, mercenario della squadra di combattimento del Pacifico Occidentale dellorganizzazione militare Mithril, oltre ad eseguire missioni militari con una squadra di mercenari, tra cui i compagni Melissa Mao, e Kurz Weber, ha inoltre il compito di proteggere Kaname Chidori, una bellissima liceale whispered, ovvero una persona che ha misteriosamente sviluppato conoscenze al di fuori del comune, mirate a tecnologie sconosciute al genere umano; per questo motivo la ragazza è bersaglio di pericolose organizzazioni e Sousuke con lintento di proteggerla frequenta la sua stessa scuola, ambiente per lui inadeguato. In Full Metal Panic Sigma è sempre più evidente la crescita del rapporto tra Sousuke e Kaname, che nonostante i continui litigi sembra sfociare in un rapporto sentimentale, inoltre Sousuke sembra sempre più legato alla sua nuova vita di normale liceale. Purtroppo i due vengono divisi dal momento che la Mithril revoca a Sousuke lincarico di proteggere la ragazza, compito assegnato a Wraith, una figura nellombra. Sousuke infatti deve occuparsi dellallenamento con lArbalest, un AS dalle capacità avanzatissime ma difficilmente controllabile. Kaname, sola a Tokyo, si sente abbandonata dallamico che non lha avvertita della sua partenza, e deve vedersela con una misteriosa assassina, mentre Sousuke è evidentemente in difficoltà e sempre più sofferente per la lontananza con la ragazza...